Anemia defisiensi besi umumnya tidak menimbulkan komplikasi. Akan tetapi, kondisi ini dapat menimbulkan komplikasi yang berbahaya jika tidak segera diobati, yaitu:
- Masalah jantung, seperti gangguan irama jantung, yang dapat memicu kardiomegali atau gagal jantung
- Komplikasi kehamilan, kelahiran prematur, atau berat badan lahir yang rendah pada bayi jika anemia terjadi pada ibu hamil
- Gangguan pertumbuhan dan rentan terkena infeksi pada bayi atau anak-anak
- Depresi